JRでは以前は各駅毎に様々な業者が入り営業していたが、1990年代半ば頃からこれらの業者を排除し、東日本旅客鉄道（JR東日本）の連結子会社である日本レストランエンタプライズ（NRE）とへと統合してきた。これにより仕入れを共通化でき原価を低減させたが、個性がなく批判的に受け止める人が多い。NREではこの批判の声を受け、近年は各地へ出店の際に、独自メニューが含まれたり、具の内容が異なる店も出現している。また、多くは「あじさい茶屋」の名称だが、最近では別の名称で出店している駅もあり、東京近辺を中心に様々な駅に出店している。
具の内容が異なる店として、品川店のみの「しながわ」、西船橋店では他店と異なるかき揚げを使用、などがある。
「あじさい茶屋」以外の名称で出店している駅としては錦糸町駅の「本所そば」、品川駅の「しながわそば」、吉祥寺駅の「そば処 井の頭」などがある。立川駅ホームの立ち食い店「奥多摩そば」もNREの店舗で、甘辛く煮た薩摩揚げなど3種の種物を選ぶことができる「おでんそば・うどん」がある。
全国的な讃岐うどんブームが起こった2002年（平成14年）より、NREが四国旅客鉄道（JR四国）系列の「めりけんや」と業務提携を行い、恵比寿駅・上野駅・新橋駅など一部の駅で讃岐うどんの専門店を営業している。
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JR東日本系列のジェイアール東日本フードビジネス（JEFB）も独自に「あずみ」「生そば あずみ」を展開しており、同じ駅にNREの「あじさい茶屋」や前述の讃岐うどん店が共存することがある。その他、以前はJR東日本直営系として、旧各鉄道管理局直営店舗からの流れをくむ各支社子会社であるジェイアール東京企画開発、ジェイアール宇都宮企画開発が展開する「喜多そば」、ジェイアール神奈川企画開発、ジェイアールかいじ企画開発が展開する「小竹林（旧・そばたいむ小竹林）」があったが、2009年4月に関連会社の整理統合に伴い、これらの店舗はNREに事業譲渡された。